２００６シーズン J2順位表
（最終節 終了時点）
順位	前順位	チーム	勝点	試合	勝	分	負	得点	失点	得失		ホーム			アウェイ
												勝	分	負	勝	分	負
１	１	横浜ＦＣ	93	48	26	15	7	61	32	29		15	5	4	11	10	3
２	３	柏	88	48	27	7	14	84	60	24		17	3	4	10	4	10
３	２	神　戸	86	48	25	11	12	78	53	25		14	5	5	11	6	7
４	４	鳥　栖	79	48	22	13	13	63	48	15		12	4	8	10	9	5
５	５	仙　台	77	48	21	14	13	75	43	32		11	9	4	10	5	9
６	６	札　幌	72	48	20	12	16	77	67	10		10	6	8	10	6	8
７	７	東京Ｖ	71	48	21	8	19	69	75	-6		12	4	8	9	4	11
８	８	山　形	65	48	17	14	17	68	57	11		11	6	7	6	8	10
９	９	愛媛ＦＣ	53	48	14	11	23	51	63	-12		6	7	11	8	4	12
１０	１０	水　戸	51	48	14	9	25	48	69	-21		8	5	11	6	4	14
１１	１１	湘　南	49	48	13	10	25	61	87	-26		10	2	12	3	8	13
１２	１２	草　津	42	48	9	15	24	54	86	-32		6	11	7	3	4	17
１３	１３	徳　島	35	48	8	11	29	43	92	-49		6	8	10	2	3	19
※第51節で、横浜ＦＣの自動昇格とＪ２優勝が決定
※第52節で、柏の自動昇格と神戸の入れ替え戦出場が決定